Молодая девушка-киллер родом с Тайваня, известная под кодовым именем Стеклянное Сердце, совершает самоубийство, прыгнув с крыши. Однако упала она не на землю, а на металлический забор, поэтому не умерла, а повредила сердце. Жизнь девушки спасли путём трансплантации сердца. Во время пребывания в коме после операции она видела странные сны, которые в дальнейшем привели её в Японию, где она стала искать донора своего сердца — Каори Макимуру, бывшего партнера Городского охотника Рё Саэбы.В первом томе танкобона автором упоминается, что «Сердце ангела» берёт только образы персонажей «Городского охотника», но не является продолжением истории. События происходят в параллельной вселенной, не имеющей ничего общего с оригинальной историей «Городского охотника».